MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 37902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	CG	4	8	223	230	0 %	0 %	50 %	50 %	387819931
2	NC_017866	GGCT	2	8	236	243	0 %	25 %	50 %	25 %	387819931
3	NC_017866	GGT	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819931
4	NC_017866	CAC	2	6	274	279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
5	NC_017866	GC	3	6	351	356	0 %	0 %	50 %	50 %	387819931
6	NC_017866	GCC	2	6	406	411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
7	NC_017866	GGA	2	6	445	450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819931
8	NC_017866	GCC	2	6	482	487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
9	NC_017866	GCG	3	9	563	571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
10	NC_017866	CGA	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
11	NC_017866	GCA	2	6	658	663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
12	NC_017866	ACG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
13	NC_017866	CAC	2	6	751	756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
14	NC_017866	CGC	2	6	771	776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
15	NC_017866	GTTC	2	8	792	799	0 %	50 %	25 %	25 %	387819931
16	NC_017866	CGG	2	6	961	966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
17	NC_017866	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	387819931
18	NC_017866	CGAG	2	8	1056	1063	25 %	0 %	50 %	25 %	387819931
19	NC_017866	ACGA	2	8	1070	1077	50 %	0 %	25 %	25 %	387819931
20	NC_017866	TGC	2	6	1164	1169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819931
21	NC_017866	CGA	2	6	1174	1179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
22	NC_017866	CGG	2	6	1192	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
23	NC_017866	TTC	2	6	1220	1225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387819931
24	NC_017866	GCC	2	6	1282	1287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
25	NC_017866	GGA	2	6	1297	1302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819931
26	NC_017866	GCC	2	6	1357	1362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
27	NC_017866	ACG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
28	NC_017866	CAA	2	6	1462	1467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819931
29	NC_017866	CT	3	6	1513	1518	0 %	50 %	0 %	50 %	387819931
30	NC_017866	ACC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
31	NC_017866	CAC	2	6	1573	1578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819931
32	NC_017866	CAT	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819931
33	NC_017866	CG	4	8	1609	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	387819931
34	NC_017866	CGA	2	6	1642	1647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
35	NC_017866	GCC	2	6	1662	1667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819931
36	NC_017866	CG	3	6	1710	1715	0 %	0 %	50 %	50 %	387819931
37	NC_017866	CGG	2	6	1756	1761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819931
38	NC_017866	ACCAC	2	10	1767	1776	40 %	0 %	0 %	60 %	387819931
39	NC_017866	CATG	2	8	1780	1787	25 %	25 %	25 %	25 %	387819931
40	NC_017866	AGC	2	6	1866	1871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819931
41	NC_017866	TTCG	2	8	2512	2519	0 %	50 %	25 %	25 %	387819932
42	NC_017866	GAC	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
43	NC_017866	ACGC	2	8	2553	2560	25 %	0 %	25 %	50 %	387819932
44	NC_017866	GGC	2	6	2596	2601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819932
45	NC_017866	CG	4	8	2644	2651	0 %	0 %	50 %	50 %	387819932
46	NC_017866	CGT	2	6	2686	2691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
47	NC_017866	GCT	2	6	2704	2709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
48	NC_017866	TGC	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819932
49	NC_017866	GAC	2	6	2764	2769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
50	NC_017866	CCGGC	2	10	2784	2793	0 %	0 %	40 %	60 %	387819932
51	NC_017866	CGA	2	6	3037	3042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
52	NC_017866	GCG	2	6	3059	3064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819932
53	NC_017866	CCGTT	2	10	3097	3106	0 %	40 %	20 %	40 %	387819932
54	NC_017866	CCG	2	6	3216	3221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819932
55	NC_017866	TGG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819932
56	NC_017866	AACGC	2	10	3315	3324	40 %	0 %	20 %	40 %	387819932
57	NC_017866	CGGC	2	8	3366	3373	0 %	0 %	50 %	50 %	387819932
58	NC_017866	GAC	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
59	NC_017866	GCA	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819932
60	NC_017866	GAG	2	6	3560	3565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819932
61	NC_017866	TCG	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
62	NC_017866	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
63	NC_017866	GCC	2	6	3863	3868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
64	NC_017866	CG	3	6	3872	3877	0 %	0 %	50 %	50 %	387819933
65	NC_017866	AGA	2	6	3883	3888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387819933
66	NC_017866	ACA	2	6	3909	3914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387819933
67	NC_017866	GAC	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
68	NC_017866	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
69	NC_017866	TCG	2	6	4038	4043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
70	NC_017866	CGA	2	6	4054	4059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
71	NC_017866	CGTT	2	8	4094	4101	0 %	50 %	25 %	25 %	387819933
72	NC_017866	GCC	2	6	4112	4117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
73	NC_017866	CG	3	6	4178	4183	0 %	0 %	50 %	50 %	387819933
74	NC_017866	AGG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819933
75	NC_017866	GAG	2	6	4229	4234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819933
76	NC_017866	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	387819933
77	NC_017866	CGT	2	6	4407	4412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
78	NC_017866	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
79	NC_017866	GGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
80	NC_017866	GAC	2	6	4556	4561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
81	NC_017866	TCG	2	6	4601	4606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
82	NC_017866	CGCTGG	2	12	4623	4634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387819933
83	NC_017866	TCT	2	6	4657	4662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387819933
84	NC_017866	GTG	2	6	4691	4696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819933
85	NC_017866	CGA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819933
86	NC_017866	CGT	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819933
87	NC_017866	ATC	2	6	4775	4780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819933
88	NC_017866	GCG	2	6	4787	4792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
89	NC_017866	GCCCAT	2	12	4823	4834	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387819933
90	NC_017866	GGC	2	6	4846	4851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
91	NC_017866	GGC	2	6	4871	4876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819933
92	NC_017866	GCCG	2	8	4906	4913	0 %	0 %	50 %	50 %	387819933
93	NC_017866	GCC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387819933
94	NC_017866	GCAT	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	387819933
95	NC_017866	GCAG	2	8	4976	4983	25 %	0 %	50 %	25 %	387819933
96	NC_017866	GAGC	2	8	5085	5092	25 %	0 %	50 %	25 %	387819933
97	NC_017866	GCCG	2	8	5133	5140	0 %	0 %	50 %	50 %	387819934
98	NC_017866	GAG	2	6	5200	5205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819934
99	NC_017866	CGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819934
100	NC_017866	GTT	2	6	5256	5261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387819934
101	NC_017866	CGCA	2	8	5352	5359	25 %	0 %	25 %	50 %	387819934
102	NC_017866	TGGG	2	8	5365	5372	0 %	25 %	75 %	0 %	387819934
103	NC_017866	CGT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819934
104	NC_017866	TGC	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819934
105	NC_017866	GCAA	2	8	5543	5550	50 %	0 %	25 %	25 %	387819934
106	NC_017866	CAAC	2	8	5786	5793	50 %	0 %	0 %	50 %	387819935
107	NC_017866	CGATC	2	10	5830	5839	20 %	20 %	20 %	40 %	387819935
108	NC_017866	ACG	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
109	NC_017866	GAC	2	6	5888	5893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
110	NC_017866	ACG	2	6	5913	5918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
111	NC_017866	CAC	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
112	NC_017866	TCG	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387819935
113	NC_017866	CGA	2	6	6112	6117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
114	NC_017866	CGA	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
115	NC_017866	CGG	2	6	6196	6201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
116	NC_017866	CGG	4	12	6208	6219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
117	NC_017866	CGG	2	6	6232	6237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
118	NC_017866	GGT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387819935
119	NC_017866	CG	3	6	6279	6284	0 %	0 %	50 %	50 %	387819935
120	NC_017866	CTA	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387819935
121	NC_017866	CGA	3	9	6379	6387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
122	NC_017866	GAC	2	6	6436	6441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
123	NC_017866	GCA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
124	NC_017866	CAG	2	6	6476	6481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
125	NC_017866	CGA	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819935
126	NC_017866	GC	3	6	6542	6547	0 %	0 %	50 %	50 %	387819935
127	NC_017866	CGGCGA	2	12	6559	6570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387819935
128	NC_017866	GGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819935
129	NC_017866	CCA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819935
130	NC_017866	GGC	2	6	6803	6808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387819935
131	NC_017866	GAG	2	6	6815	6820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387819935
132	NC_017866	CG	3	6	6827	6832	0 %	0 %	50 %	50 %	387819935
133	NC_017866	CAAAGA	2	12	6880	6891	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	387819935
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261	NC_017866	ACC	2	6	11655	11660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387819938
262	NC_017866	CGA	2	6	11746	11751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387819938
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